疫情之下 基因測序水平應是衛生系統核心能力

張夢然

2021年02月18日09:00  來源:科技日報
 

  先進的基因測序技術,在此次人類針對新冠病毒的生物學研究和進化方面提供了非常寶貴的信息。英國《柳葉刀》期刊近日發表社論指出:目前全球范圍內,各國在基因組測序水平的巨大差異,威脅著所有國家監測和應對疫情的能力。而全球基因組實時監測,必須是公共衛生措施資源庫中的關鍵工具,並成為衛生對策基礎。

  文章稱,一些科學家、公共衛生專家等人士,此前從未對一種病毒的近30000個核苷酸進行過如此密切的研究。充分了解新冠病毒的RNA序列是鑒定的關鍵,及早地共享其基因數據不但有助於診斷技術的快速研發,也是疫苗能快速生產的“功臣”。

  而將測序與流行病學數據相結合,則可提供有關新變異毒株的實時信息——譬如近期發現的三種變異,引起全世界人們的高度關注,其動態變化的進程依然令人擔心,其中一些變異似乎更容易傳播﹔此外,科學家還發現了一些突變,其會使人群對幾種單克隆中和抗體產生抗藥性,並降低恢復期血漿的有效性。這些意味著,公共衛生響應必須適應這種發展,及時地發現突變,以保持醫療對策的有效性。

  疫情中的測序工作仍在不斷進展中。英國“COVID-19基因組學聯盟”表示,到今年3月,該機構將把新冠病毒基因組測序的工作量增加到每周2萬次﹔世界衛生組織則呼吁非洲國家“建立並加強”基因組監測,並要求各國通過新冠病毒基因組測序網絡,每月至少向測序實驗室運送20個樣本﹔在美國,總統首席醫學顧問安東尼·福奇亦承諾將擴大基因組監測的規模。

  但社論文章指出,在全球范圍內,對新冠病毒基因組的監測工作仍然參差不齊。數據顯示,以每千例病例的病毒基因組為單位,許多高收入國家(如冰島、盧森堡和日本)進行的測序工作最多,而像伊拉克和委內瑞拉等國家的測序工作最少,一些非洲國家根本沒有測序數據。

  另一方面,岡比亞、赤道幾內亞和塞拉利昂的測序率,會高於法國、意大利或美國,這也表明經濟實力並不是影響測序能力的唯一因素。非洲疾病防控中心表示,非洲已經能夠利用從其他傳染病暴發中獲得的技術知識,去迅速適應新冠疫情。

  《柳葉刀》最后給出了一個基因組監測系統的理想狀態:首先,其無需對每位患者的病毒基因組進行測序,但測序水平應當能夠充分檢測並跟蹤突變及其影響,這是衛生系統的核心能力,無論是對現在的新冠病毒,還是對未來的新發疾病﹔其次,需要了解變化對病毒生物學的影響,並將研究結果與臨床數據相聯系,以制定有效的公共衛生政策﹔最后,新冠病毒不分國界,因此,有效的病毒基因組監測需要成為全球關注的問題。在任何疫情暴發時,都必須將測序工作廣泛落實。

(責編:金忠耀、王麗瑋)

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